通草与木通的区别主要体现在来源、性味归经、功效主治及用量禁忌四个方面。
一、来源不同通草来源于五加科植物通脱木的干燥茎髓，属于植物的髓质部分，质地轻软，呈白色圆柱形薄片。木通来源于木通科植物木通、三叶木通或白木通的干燥藤茎，属于木质藤本植物的茎部，质地坚硬，断面可见放射状纹理。两者虽名称相近，但植物科属完全不同，通草为五加科，木通为木通科，这是二者最本质的区别。
二、性味归经不同通草味甘、淡，性微寒，归肺、胃经，药性平和，以清热利湿、通气下乳为主。木通味苦，性寒，归心、小肠、膀胱经，苦寒之性较通草更强，主入心与小肠，擅长清心火、利小便。通草偏于走气分，作用于肺胃；木通偏于走血分与水道，作用于心与小肠，二者归经差异决定了其临床应用的侧重方向不同。
三、功效主治不同通草主要功效为清热利尿、通气下乳，常用于湿热尿赤、淋病涩痛、水肿尿少、乳汁不下等症，尤其适用于产后缺乳兼有湿热者。木通主要功效为利尿通淋、清心除烦、通经下乳，常用于胸中烦热、口舌生疮、目赤肿痛、经闭痛经、湿热淋证等症，尤擅治疗心火上炎所致的小便短赤与口舌糜烂。通草以下乳见长，木通以清心火见长，二者不可混用替代。
四、用量禁忌不同通草用量一般为3-5克，煎服，因其质轻，过量易致腹泻，孕妇慎用。木通用量一般为3-6克，煎服，因含马兜铃酸类成分关木通已禁用，长期或大量使用可能损伤肾功能，脾胃虚寒、滑精、遗尿者忌服，孕妇禁用。临床须严格区分川木通、关木通与木通科木通，避免误用导致肾毒性风险，用药须在医师指导下进行。
