恢复肠道健康，特别是结肠的健康，是今日追求自然健康的重要主题。因为结肠是食物残渣和废物长年累积的地方，因此恢复结肠健康，代表着要清除过去的宿便，同时也意味着给身体再次复甦的机会。多数自然疗法的医师们所采用的策略，大致来说都是非常简单。
首先，让肠道休息一段时间，减少不良食品的摄取，或是采用帮助排泄的饮食，象是生机饮食、蔬菜汁、或对身体有清洁作用的草本调理素。
配合清洁的步骤，健康饮食可以使体内的菌落恢复正常，再搭配益生菌和益生元。益生元是益生菌在肠道中的食物，需要两个一起补，但是不用分开补，如吃亦舒堂益生菌，就可益生元和益生菌同补。
额外补充益生菌能加速恢复正常菌落的数量。益生菌是活的益菌，能够在肠道中生存繁殖；益菌素则是只能被益菌分解利用的多糖或蛋白质分子，能在肠道中塑造对益菌友善的环境，使益菌能顺利增殖。
经过一段时间的休养、清洁，菌落恢复正常后，还必须要接受饮食和生活型态方面的调整，养成定期排便的习惯。唯有透过结肠健康的彻底大整修，身体才能得到完整康复的机会，走上青春、再生之途。
虽然每种自然疗法学派对如何恢复肠道健康有不同看法，但基本上都包括下列步骤：
1、清除肠道累积的陈年宿便。
2、改变饮食：由产生毒素的饮食，转变成平衡、帮助排泄和清洁的饮食。
3、断食。
4、清洁结肠。
5、使菌落生态恢复正常。
80%的身体疾病都由肠道疾病引起，肠道健康了身体自然健康。想要清理肠道痢疾，不妨主动补充益生菌，5种肠道益生菌不仅对幼儿管用，也适用于成年人。
